Im Jahr 1938 wurde Moldavia wie alle anderen Studentenverbindungen aufgelöst. Trotz offiziellen Auftrittsverbots kamen die Bundesbrüder auch in den Wirren des Zweiten Weltkriegs zusammen. Der Krieg riss auch viele tapfere Moldaven aus dem Leben. Erst 1951 konnte die Burschenschaft wieder aufsperren.
Obwohl der Bund 1969 zur einstweiligen Vertagung gezwungen war, gelang 1995 endgültig die Reaktivierung. Seit bald zwanzig Jahren ist die Wiener akademische Burschenschaft Moldavia wieder in der Donaustadt vertreten. Die ständig wachsende Gemeinschaft lehrt uns, die Grundsätze der Gründungsväter immer neu zu (er)leben. Eine neue Blütezeit ist da.